近日，中國科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所研究員王方軍團隊在蛋白質(zhì)復(fù)合物形成和干預(yù)機制分析新方法研究方面取得進展，通過溶液狀態(tài)蛋白質(zhì)賴氨酸兩步穩(wěn)定同位素標(biāo)記和定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析，實現(xiàn)對蛋白—蛋白識別關(guān)鍵位點區(qū)域的精確探測，并可評估小分子對蛋白質(zhì)復(fù)合物的構(gòu)象識別干預(yù)情況。

蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和相互作用決定了其生物學(xué)功能，目前對溶液狀態(tài)蛋白—蛋白識別和結(jié)構(gòu)動態(tài)變化研究仍然缺乏高靈敏度的分析方法。此前，研究團隊發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)上賴氨酸的原位標(biāo)記反應(yīng)性與其所處微觀結(jié)構(gòu)中的氫鍵、靜電相互作用強度密切相關(guān)；提出以蛋白質(zhì)上所有賴氨酸位點為內(nèi)源性反應(yīng)探針，通過定量賴氨酸在蛋白—蛋白，蛋白—小分子結(jié)合前后的標(biāo)記反應(yīng)性變化，精確探測蛋白質(zhì)識別過程中的關(guān)鍵區(qū)域。

為進一步提高賴氨酸反應(yīng)性定量分析的通量和靈敏度，該團隊進一步發(fā)展了溶液狀態(tài)蛋白質(zhì)“活性—變性”賴氨酸兩步穩(wěn)定同位素標(biāo)記定量策略（TILLRP），系統(tǒng)研究了重組SARS-CoV-2 S1蛋白質(zhì)和人體ACE2受體之間的相互作用情況；發(fā)現(xiàn)S1蛋白質(zhì)RBD Lys386-Lys462區(qū)域的賴氨酸位點在S1-ACE2復(fù)合物形成前后標(biāo)記反應(yīng)性發(fā)生了顯著改變；提出可以利用該區(qū)域賴氨酸的標(biāo)記反應(yīng)性調(diào)控水平評估小分子活性物質(zhì)對S1-ACE2識別的干預(yù)情況，可能有助于相關(guān)治療藥物分子的研發(fā)。

該研究結(jié)果發(fā)表在《化學(xué)科學(xué)》（Chemical Science）上。上述研究工作得到國家自然科學(xué)基金、大連化物所創(chuàng)新基金等項目的資助。

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大連化物所提出蛋白質(zhì)相互作用識別和干預(yù)機制分析新方法